Protein–RNA interactions for Protein: Q6FI13

HIST2H2AA3, Histone H2A type 2-A, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2AA3Q6FI13 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIST2H2AA3Q6FI13 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIST2H2AA3Q6FI13 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIST2H2AA3Q6FI13 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIST2H2AA3Q6FI13 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIST2H2AA3Q6FI13 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIST2H2AA3Q6FI13 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIST2H2AA3Q6FI13 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIST2H2AA3Q6FI13 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIST2H2AA3Q6FI13 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIST2H2AA3Q6FI13 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIST2H2AA3Q6FI13 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIST2H2AA3Q6FI13 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIST2H2AA3Q6FI13 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIST2H2AA3Q6FI13 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIST2H2AA3Q6FI13 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIST2H2AA3Q6FI13 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIST2H2AA3Q6FI13 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIST2H2AA3Q6FI13 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIST2H2AA3Q6FI13 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIST2H2AA3Q6FI13 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIST2H2AA3Q6FI13 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIST2H2AA3Q6FI13 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIST2H2AA3Q6FI13 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HIST2H2AA3Q6FI13 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.3 ms