Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
CARMIL2Q6F5E8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
CARMIL2Q6F5E8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
CARMIL2Q6F5E8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
CARMIL2Q6F5E8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
CARMIL2Q6F5E8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CARMIL2Q6F5E8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CARMIL2Q6F5E8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CARMIL2Q6F5E8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CARMIL2Q6F5E8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CARMIL2Q6F5E8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CARMIL2Q6F5E8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CARMIL2Q6F5E8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CARMIL2Q6F5E8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
CARMIL2Q6F5E8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
CARMIL2Q6F5E8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
CARMIL2Q6F5E8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CARMIL2Q6F5E8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CARMIL2Q6F5E8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CARMIL2Q6F5E8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CARMIL2Q6F5E8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
CARMIL2Q6F5E8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CARMIL2Q6F5E8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
CARMIL2Q6F5E8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
CARMIL2Q6F5E8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
CARMIL2Q6F5E8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CARMIL2Q6F5E8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CARMIL2Q6F5E8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CARMIL2Q6F5E8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CARMIL2Q6F5E8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CARMIL2Q6F5E8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
CARMIL2Q6F5E8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CARMIL2Q6F5E8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CARMIL2Q6F5E8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CARMIL2Q6F5E8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CARMIL2Q6F5E8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
CARMIL2Q6F5E8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
CARMIL2Q6F5E8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
CARMIL2Q6F5E8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
CARMIL2Q6F5E8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
CARMIL2Q6F5E8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CARMIL2Q6F5E8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
CARMIL2Q6F5E8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
CARMIL2Q6F5E8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CARMIL2Q6F5E8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CARMIL2Q6F5E8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
CARMIL2Q6F5E8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
CARMIL2Q6F5E8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
CARMIL2Q6F5E8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CARMIL2Q6F5E8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CARMIL2Q6F5E8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CARMIL2Q6F5E8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
CARMIL2Q6F5E8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
CARMIL2Q6F5E8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
CARMIL2Q6F5E8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CARMIL2Q6F5E8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CARMIL2Q6F5E8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CARMIL2Q6F5E8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
CARMIL2Q6F5E8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CARMIL2Q6F5E8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CARMIL2Q6F5E8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CARMIL2Q6F5E8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CARMIL2Q6F5E8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
CARMIL2Q6F5E8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
CARMIL2Q6F5E8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CARMIL2Q6F5E8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
CARMIL2Q6F5E8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CARMIL2Q6F5E8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
CARMIL2Q6F5E8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CARMIL2Q6F5E8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CARMIL2Q6F5E8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CARMIL2Q6F5E8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CARMIL2Q6F5E8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CARMIL2Q6F5E8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CARMIL2Q6F5E8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
CARMIL2Q6F5E8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CARMIL2Q6F5E8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CARMIL2Q6F5E8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CARMIL2Q6F5E8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CARMIL2Q6F5E8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CARMIL2Q6F5E8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CARMIL2Q6F5E8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CARMIL2Q6F5E8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CARMIL2Q6F5E8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
CARMIL2Q6F5E8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CARMIL2Q6F5E8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CARMIL2Q6F5E8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CARMIL2Q6F5E8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CARMIL2Q6F5E8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CARMIL2Q6F5E8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
CARMIL2Q6F5E8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
CARMIL2Q6F5E8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
CARMIL2Q6F5E8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
CARMIL2Q6F5E8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
CARMIL2Q6F5E8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
CARMIL2Q6F5E8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
CARMIL2Q6F5E8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
CARMIL2Q6F5E8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CARMIL2Q6F5E8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms