Protein–RNA interactions for Protein: Q5XLA6

CARD17, Caspase recruitment domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD17Q5XLA6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARD17Q5XLA6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARD17Q5XLA6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARD17Q5XLA6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARD17Q5XLA6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARD17Q5XLA6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD17Q5XLA6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD17Q5XLA6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD17Q5XLA6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD17Q5XLA6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD17Q5XLA6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD17Q5XLA6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD17Q5XLA6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD17Q5XLA6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD17Q5XLA6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD17Q5XLA6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD17Q5XLA6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD17Q5XLA6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD17Q5XLA6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD17Q5XLA6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD17Q5XLA6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD17Q5XLA6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD17Q5XLA6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD17Q5XLA6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD17Q5XLA6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD17Q5XLA6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD17Q5XLA6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CARD17Q5XLA6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD17Q5XLA6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms