Protein–RNA interactions for Protein: Q5TB30

DEPDC1, DEP domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1Q5TB30 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DEPDC1Q5TB30 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEPDC1Q5TB30 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEPDC1Q5TB30 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DEPDC1Q5TB30 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEPDC1Q5TB30 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEPDC1Q5TB30 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEPDC1Q5TB30 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEPDC1Q5TB30 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEPDC1Q5TB30 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEPDC1Q5TB30 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEPDC1Q5TB30 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEPDC1Q5TB30 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DEPDC1Q5TB30 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DEPDC1Q5TB30 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPDC1Q5TB30 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DEPDC1Q5TB30 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC1Q5TB30 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC1Q5TB30 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC1Q5TB30 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC1Q5TB30 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC1Q5TB30 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC1Q5TB30 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEPDC1Q5TB30 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEPDC1Q5TB30 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEPDC1Q5TB30 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEPDC1Q5TB30 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEPDC1Q5TB30 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEPDC1Q5TB30 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEPDC1Q5TB30 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEPDC1Q5TB30 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DEPDC1Q5TB30 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DEPDC1Q5TB30 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DEPDC1Q5TB30 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DEPDC1Q5TB30 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DEPDC1Q5TB30 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms