Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
CCDC18Q5T9S5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
CCDC18Q5T9S5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CCDC18Q5T9S5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CCDC18Q5T9S5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
CCDC18Q5T9S5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC39.6■■■■□ 3.93
CCDC18Q5T9S5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CCDC18Q5T9S5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CCDC18Q5T9S5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
CCDC18Q5T9S5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
CCDC18Q5T9S5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CCDC18Q5T9S5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
CCDC18Q5T9S5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CCDC18Q5T9S5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CCDC18Q5T9S5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC39.57■■■■□ 3.93
CCDC18Q5T9S5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
CCDC18Q5T9S5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
CCDC18Q5T9S5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
CCDC18Q5T9S5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
CCDC18Q5T9S5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
CCDC18Q5T9S5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CCDC18Q5T9S5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CCDC18Q5T9S5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CCDC18Q5T9S5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CCDC18Q5T9S5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CCDC18Q5T9S5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CCDC18Q5T9S5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CCDC18Q5T9S5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
CCDC18Q5T9S5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CCDC18Q5T9S5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CCDC18Q5T9S5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CCDC18Q5T9S5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
CCDC18Q5T9S5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
CCDC18Q5T9S5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
CCDC18Q5T9S5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
CCDC18Q5T9S5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CCDC18Q5T9S5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
CCDC18Q5T9S5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
CCDC18Q5T9S5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CCDC18Q5T9S5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CCDC18Q5T9S5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
CCDC18Q5T9S5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
CCDC18Q5T9S5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
CCDC18Q5T9S5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
CCDC18Q5T9S5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CCDC18Q5T9S5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
CCDC18Q5T9S5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CCDC18Q5T9S5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CCDC18Q5T9S5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CCDC18Q5T9S5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
CCDC18Q5T9S5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CCDC18Q5T9S5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
CCDC18Q5T9S5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CCDC18Q5T9S5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CCDC18Q5T9S5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CCDC18Q5T9S5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
CCDC18Q5T9S5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CCDC18Q5T9S5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC18Q5T9S5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC18Q5T9S5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC18Q5T9S5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC18Q5T9S5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC18Q5T9S5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CCDC18Q5T9S5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
CCDC18Q5T9S5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CCDC18Q5T9S5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CCDC18Q5T9S5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
CCDC18Q5T9S5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
CCDC18Q5T9S5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CCDC18Q5T9S5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CCDC18Q5T9S5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CCDC18Q5T9S5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CCDC18Q5T9S5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CCDC18Q5T9S5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms