Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY80

CATSPERE, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPEREQ5SY80 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATSPEREQ5SY80 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATSPEREQ5SY80 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATSPEREQ5SY80 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATSPEREQ5SY80 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATSPEREQ5SY80 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATSPEREQ5SY80 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATSPEREQ5SY80 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATSPEREQ5SY80 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATSPEREQ5SY80 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CATSPEREQ5SY80 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CATSPEREQ5SY80 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CATSPEREQ5SY80 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CATSPEREQ5SY80 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CATSPEREQ5SY80 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CATSPEREQ5SY80 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CATSPEREQ5SY80 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CATSPEREQ5SY80 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CATSPEREQ5SY80 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CATSPEREQ5SY80 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CATSPEREQ5SY80 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CATSPEREQ5SY80 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CATSPEREQ5SY80 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CATSPEREQ5SY80 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CATSPEREQ5SY80 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CATSPEREQ5SY80 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CATSPEREQ5SY80 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CATSPEREQ5SY80 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CATSPEREQ5SY80 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CATSPEREQ5SY80 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CATSPEREQ5SY80 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CATSPEREQ5SY80 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CATSPEREQ5SY80 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CATSPEREQ5SY80 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CATSPEREQ5SY80 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CATSPEREQ5SY80 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CATSPEREQ5SY80 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CATSPEREQ5SY80 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CATSPEREQ5SY80 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CATSPEREQ5SY80 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms