Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PERM1Q5SV97 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PERM1Q5SV97 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PERM1Q5SV97 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PERM1Q5SV97 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PERM1Q5SV97 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PERM1Q5SV97 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PERM1Q5SV97 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PERM1Q5SV97 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PERM1Q5SV97 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PERM1Q5SV97 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PERM1Q5SV97 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PERM1Q5SV97 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PERM1Q5SV97 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PERM1Q5SV97 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PERM1Q5SV97 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PERM1Q5SV97 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PERM1Q5SV97 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PERM1Q5SV97 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PERM1Q5SV97 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PERM1Q5SV97 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PERM1Q5SV97 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PERM1Q5SV97 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PERM1Q5SV97 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PERM1Q5SV97 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms