Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNT2

TMEM201, Transmembrane protein 201, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201Q5SNT2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM201Q5SNT2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM201Q5SNT2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM201Q5SNT2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM201Q5SNT2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM201Q5SNT2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM201Q5SNT2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM201Q5SNT2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM201Q5SNT2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM201Q5SNT2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM201Q5SNT2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM201Q5SNT2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM201Q5SNT2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM201Q5SNT2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM201Q5SNT2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM201Q5SNT2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM201Q5SNT2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM201Q5SNT2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM201Q5SNT2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM201Q5SNT2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM201Q5SNT2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM201Q5SNT2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM201Q5SNT2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM201Q5SNT2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM201Q5SNT2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM201Q5SNT2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM201Q5SNT2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM201Q5SNT2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM201Q5SNT2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM201Q5SNT2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM201Q5SNT2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM201Q5SNT2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM201Q5SNT2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM201Q5SNT2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM201Q5SNT2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM201Q5SNT2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM201Q5SNT2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM201Q5SNT2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM201Q5SNT2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM201Q5SNT2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms