Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNZ9

WIPI1, WD repeat domain phosphoinositide-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPI1Q5MNZ9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WIPI1Q5MNZ9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WIPI1Q5MNZ9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WIPI1Q5MNZ9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
WIPI1Q5MNZ9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WIPI1Q5MNZ9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WIPI1Q5MNZ9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WIPI1Q5MNZ9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WIPI1Q5MNZ9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WIPI1Q5MNZ9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WIPI1Q5MNZ9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WIPI1Q5MNZ9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
WIPI1Q5MNZ9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WIPI1Q5MNZ9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WIPI1Q5MNZ9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WIPI1Q5MNZ9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WIPI1Q5MNZ9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WIPI1Q5MNZ9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
WIPI1Q5MNZ9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WIPI1Q5MNZ9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WIPI1Q5MNZ9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WIPI1Q5MNZ9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WIPI1Q5MNZ9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WIPI1Q5MNZ9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WIPI1Q5MNZ9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WIPI1Q5MNZ9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WIPI1Q5MNZ9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WIPI1Q5MNZ9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WIPI1Q5MNZ9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WIPI1Q5MNZ9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WIPI1Q5MNZ9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WIPI1Q5MNZ9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WIPI1Q5MNZ9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms