Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRA6

MIA3, Transport and Golgi organization protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIA3Q5JRA6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MIA3Q5JRA6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MIA3Q5JRA6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.8
MIA3Q5JRA6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
MIA3Q5JRA6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MIA3Q5JRA6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MIA3Q5JRA6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MIA3Q5JRA6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MIA3Q5JRA6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MIA3Q5JRA6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MIA3Q5JRA6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MIA3Q5JRA6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIA3Q5JRA6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIA3Q5JRA6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIA3Q5JRA6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIA3Q5JRA6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIA3Q5JRA6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MIA3Q5JRA6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MIA3Q5JRA6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MIA3Q5JRA6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MIA3Q5JRA6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MIA3Q5JRA6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MIA3Q5JRA6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MIA3Q5JRA6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MIA3Q5JRA6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MIA3Q5JRA6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MIA3Q5JRA6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MIA3Q5JRA6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MIA3Q5JRA6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MIA3Q5JRA6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
MIA3Q5JRA6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MIA3Q5JRA6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MIA3Q5JRA6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MIA3Q5JRA6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MIA3Q5JRA6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MIA3Q5JRA6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MIA3Q5JRA6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MIA3Q5JRA6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MIA3Q5JRA6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MIA3Q5JRA6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MIA3Q5JRA6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MIA3Q5JRA6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MIA3Q5JRA6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MIA3Q5JRA6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.5 ms