Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRB2Q5IJ48 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRB2Q5IJ48 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CRB2Q5IJ48 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRB2Q5IJ48 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRB2Q5IJ48 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRB2Q5IJ48 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRB2Q5IJ48 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRB2Q5IJ48 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRB2Q5IJ48 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRB2Q5IJ48 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRB2Q5IJ48 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB2Q5IJ48 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB2Q5IJ48 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB2Q5IJ48 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRB2Q5IJ48 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRB2Q5IJ48 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRB2Q5IJ48 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRB2Q5IJ48 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRB2Q5IJ48 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRB2Q5IJ48 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRB2Q5IJ48 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRB2Q5IJ48 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRB2Q5IJ48 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRB2Q5IJ48 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRB2Q5IJ48 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRB2Q5IJ48 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRB2Q5IJ48 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms