Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF628Q5EBL2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF628Q5EBL2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF628Q5EBL2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF628Q5EBL2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF628Q5EBL2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF628Q5EBL2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF628Q5EBL2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF628Q5EBL2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF628Q5EBL2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF628Q5EBL2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF628Q5EBL2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF628Q5EBL2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF628Q5EBL2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF628Q5EBL2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF628Q5EBL2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF628Q5EBL2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF628Q5EBL2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF628Q5EBL2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF628Q5EBL2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF628Q5EBL2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF628Q5EBL2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF628Q5EBL2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF628Q5EBL2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF628Q5EBL2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF628Q5EBL2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF628Q5EBL2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF628Q5EBL2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF628Q5EBL2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF628Q5EBL2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF628Q5EBL2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF628Q5EBL2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF628Q5EBL2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF628Q5EBL2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF628Q5EBL2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF628Q5EBL2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF628Q5EBL2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF628Q5EBL2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF628Q5EBL2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF628Q5EBL2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms