Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CDCA8Q53HL2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CDCA8Q53HL2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CDCA8Q53HL2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CDCA8Q53HL2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CDCA8Q53HL2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CDCA8Q53HL2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CDCA8Q53HL2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CDCA8Q53HL2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CDCA8Q53HL2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
CDCA8Q53HL2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CDCA8Q53HL2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
CDCA8Q53HL2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CDCA8Q53HL2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CDCA8Q53HL2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CDCA8Q53HL2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CDCA8Q53HL2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CDCA8Q53HL2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CDCA8Q53HL2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CDCA8Q53HL2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CDCA8Q53HL2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CDCA8Q53HL2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CDCA8Q53HL2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CDCA8Q53HL2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CDCA8Q53HL2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CDCA8Q53HL2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CDCA8Q53HL2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35■■■■□ 3.19
CDCA8Q53HL2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CDCA8Q53HL2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CDCA8Q53HL2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CDCA8Q53HL2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CDCA8Q53HL2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CDCA8Q53HL2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CDCA8Q53HL2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CDCA8Q53HL2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CDCA8Q53HL2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CDCA8Q53HL2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CDCA8Q53HL2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
CDCA8Q53HL2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CDCA8Q53HL2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CDCA8Q53HL2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CDCA8Q53HL2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CDCA8Q53HL2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CDCA8Q53HL2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CDCA8Q53HL2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CDCA8Q53HL2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CDCA8Q53HL2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CDCA8Q53HL2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CDCA8Q53HL2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CDCA8Q53HL2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CDCA8Q53HL2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.18
CDCA8Q53HL2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.18
CDCA8Q53HL2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
CDCA8Q53HL2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
CDCA8Q53HL2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CDCA8Q53HL2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CDCA8Q53HL2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CDCA8Q53HL2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CDCA8Q53HL2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CDCA8Q53HL2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CDCA8Q53HL2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CDCA8Q53HL2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CDCA8Q53HL2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
CDCA8Q53HL2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CDCA8Q53HL2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CDCA8Q53HL2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CDCA8Q53HL2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CDCA8Q53HL2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CDCA8Q53HL2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CDCA8Q53HL2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CDCA8Q53HL2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CDCA8Q53HL2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CDCA8Q53HL2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CDCA8Q53HL2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.5 ms