Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SBK1Q52WX2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SBK1Q52WX2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SBK1Q52WX2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SBK1Q52WX2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SBK1Q52WX2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SBK1Q52WX2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SBK1Q52WX2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SBK1Q52WX2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SBK1Q52WX2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SBK1Q52WX2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SBK1Q52WX2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SBK1Q52WX2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SBK1Q52WX2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SBK1Q52WX2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SBK1Q52WX2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SBK1Q52WX2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SBK1Q52WX2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SBK1Q52WX2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SBK1Q52WX2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SBK1Q52WX2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SBK1Q52WX2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SBK1Q52WX2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SBK1Q52WX2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SBK1Q52WX2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SBK1Q52WX2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SBK1Q52WX2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SBK1Q52WX2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SBK1Q52WX2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SBK1Q52WX2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SBK1Q52WX2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SBK1Q52WX2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SBK1Q52WX2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SBK1Q52WX2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SBK1Q52WX2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SBK1Q52WX2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SBK1Q52WX2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SBK1Q52WX2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SBK1Q52WX2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SBK1Q52WX2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SBK1Q52WX2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms