Protein–RNA interactions for Protein: Q4AE62

GTDC1, Glycosyltransferase-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTDC1Q4AE62 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTDC1Q4AE62 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTDC1Q4AE62 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTDC1Q4AE62 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTDC1Q4AE62 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTDC1Q4AE62 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTDC1Q4AE62 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTDC1Q4AE62 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GTDC1Q4AE62 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTDC1Q4AE62 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTDC1Q4AE62 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTDC1Q4AE62 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTDC1Q4AE62 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTDC1Q4AE62 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTDC1Q4AE62 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTDC1Q4AE62 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTDC1Q4AE62 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTDC1Q4AE62 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTDC1Q4AE62 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTDC1Q4AE62 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTDC1Q4AE62 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTDC1Q4AE62 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTDC1Q4AE62 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTDC1Q4AE62 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTDC1Q4AE62 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTDC1Q4AE62 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTDC1Q4AE62 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTDC1Q4AE62 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTDC1Q4AE62 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTDC1Q4AE62 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTDC1Q4AE62 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTDC1Q4AE62 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTDC1Q4AE62 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTDC1Q4AE62 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTDC1Q4AE62 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTDC1Q4AE62 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTDC1Q4AE62 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTDC1Q4AE62 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTDC1Q4AE62 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTDC1Q4AE62 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTDC1Q4AE62 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTDC1Q4AE62 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTDC1Q4AE62 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GTDC1Q4AE62 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTDC1Q4AE62 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTDC1Q4AE62 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTDC1Q4AE62 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTDC1Q4AE62 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTDC1Q4AE62 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTDC1Q4AE62 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GTDC1Q4AE62 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTDC1Q4AE62 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTDC1Q4AE62 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GTDC1Q4AE62 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTDC1Q4AE62 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTDC1Q4AE62 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTDC1Q4AE62 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTDC1Q4AE62 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTDC1Q4AE62 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTDC1Q4AE62 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTDC1Q4AE62 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTDC1Q4AE62 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTDC1Q4AE62 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTDC1Q4AE62 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTDC1Q4AE62 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 276.3 ms