Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAF6Q330K2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAF6Q330K2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAF6Q330K2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFAF6Q330K2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFAF6Q330K2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFAF6Q330K2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFAF6Q330K2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFAF6Q330K2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFAF6Q330K2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFAF6Q330K2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFAF6Q330K2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFAF6Q330K2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFAF6Q330K2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDUFAF6Q330K2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFAF6Q330K2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms