Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
P3H1Q32P28 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
P3H1Q32P28 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
P3H1Q32P28 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
P3H1Q32P28 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
P3H1Q32P28 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
P3H1Q32P28 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
P3H1Q32P28 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
P3H1Q32P28 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
P3H1Q32P28 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
P3H1Q32P28 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
P3H1Q32P28 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
P3H1Q32P28 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
P3H1Q32P28 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
P3H1Q32P28 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
P3H1Q32P28 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
P3H1Q32P28 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
P3H1Q32P28 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
P3H1Q32P28 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
P3H1Q32P28 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
P3H1Q32P28 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
P3H1Q32P28 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
P3H1Q32P28 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
P3H1Q32P28 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
P3H1Q32P28 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
P3H1Q32P28 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
P3H1Q32P28 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
P3H1Q32P28 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
P3H1Q32P28 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
P3H1Q32P28 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
P3H1Q32P28 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
P3H1Q32P28 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
P3H1Q32P28 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
P3H1Q32P28 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
P3H1Q32P28 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
P3H1Q32P28 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
P3H1Q32P28 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
P3H1Q32P28 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
P3H1Q32P28 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
P3H1Q32P28 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
P3H1Q32P28 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
P3H1Q32P28 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
P3H1Q32P28 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
P3H1Q32P28 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
P3H1Q32P28 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms