Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC96Q2M329 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC96Q2M329 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC96Q2M329 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC96Q2M329 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC96Q2M329 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC96Q2M329 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC96Q2M329 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC96Q2M329 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC96Q2M329 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC96Q2M329 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC96Q2M329 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC96Q2M329 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC96Q2M329 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC96Q2M329 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC96Q2M329 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC96Q2M329 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC96Q2M329 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC96Q2M329 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC96Q2M329 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC96Q2M329 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC96Q2M329 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC96Q2M329 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC96Q2M329 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC96Q2M329 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC96Q2M329 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC96Q2M329 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC96Q2M329 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC96Q2M329 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC96Q2M329 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC96Q2M329 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC96Q2M329 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC96Q2M329 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC96Q2M329 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC96Q2M329 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC96Q2M329 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC96Q2M329 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC96Q2M329 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC96Q2M329 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC96Q2M329 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC96Q2M329 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC96Q2M329 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC96Q2M329 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms