Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
KRT24Q2M2I5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KRT24Q2M2I5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KRT24Q2M2I5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
KRT24Q2M2I5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KRT24Q2M2I5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KRT24Q2M2I5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KRT24Q2M2I5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KRT24Q2M2I5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KRT24Q2M2I5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KRT24Q2M2I5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KRT24Q2M2I5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KRT24Q2M2I5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KRT24Q2M2I5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KRT24Q2M2I5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KRT24Q2M2I5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KRT24Q2M2I5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KRT24Q2M2I5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KRT24Q2M2I5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KRT24Q2M2I5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KRT24Q2M2I5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
KRT24Q2M2I5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
KRT24Q2M2I5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KRT24Q2M2I5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KRT24Q2M2I5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KRT24Q2M2I5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
KRT24Q2M2I5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KRT24Q2M2I5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
KRT24Q2M2I5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KRT24Q2M2I5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KRT24Q2M2I5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
KRT24Q2M2I5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KRT24Q2M2I5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KRT24Q2M2I5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
KRT24Q2M2I5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
KRT24Q2M2I5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
KRT24Q2M2I5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KRT24Q2M2I5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KRT24Q2M2I5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KRT24Q2M2I5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KRT24Q2M2I5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KRT24Q2M2I5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
KRT24Q2M2I5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
KRT24Q2M2I5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
KRT24Q2M2I5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KRT24Q2M2I5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KRT24Q2M2I5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KRT24Q2M2I5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KRT24Q2M2I5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KRT24Q2M2I5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KRT24Q2M2I5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KRT24Q2M2I5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KRT24Q2M2I5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KRT24Q2M2I5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KRT24Q2M2I5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KRT24Q2M2I5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KRT24Q2M2I5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KRT24Q2M2I5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KRT24Q2M2I5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
KRT24Q2M2I5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
KRT24Q2M2I5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
KRT24Q2M2I5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KRT24Q2M2I5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
KRT24Q2M2I5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KRT24Q2M2I5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KRT24Q2M2I5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KRT24Q2M2I5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
KRT24Q2M2I5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KRT24Q2M2I5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KRT24Q2M2I5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
KRT24Q2M2I5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
KRT24Q2M2I5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
KRT24Q2M2I5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
KRT24Q2M2I5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
KRT24Q2M2I5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
KRT24Q2M2I5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KRT24Q2M2I5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KRT24Q2M2I5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KRT24Q2M2I5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KRT24Q2M2I5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
KRT24Q2M2I5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KRT24Q2M2I5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KRT24Q2M2I5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KRT24Q2M2I5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KRT24Q2M2I5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KRT24Q2M2I5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KRT24Q2M2I5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
KRT24Q2M2I5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
KRT24Q2M2I5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
KRT24Q2M2I5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KRT24Q2M2I5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KRT24Q2M2I5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KRT24Q2M2I5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KRT24Q2M2I5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KRT24Q2M2I5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KRT24Q2M2I5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
KRT24Q2M2I5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KRT24Q2M2I5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
KRT24Q2M2I5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
KRT24Q2M2I5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms