Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDR2Q16832 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDR2Q16832 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDR2Q16832 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDR2Q16832 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
DDR2Q16832 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDR2Q16832 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDR2Q16832 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDR2Q16832 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDR2Q16832 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDR2Q16832 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDR2Q16832 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DDR2Q16832 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDR2Q16832 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DDR2Q16832 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDR2Q16832 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDR2Q16832 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDR2Q16832 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDR2Q16832 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDR2Q16832 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDR2Q16832 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDR2Q16832 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDR2Q16832 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDR2Q16832 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDR2Q16832 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDR2Q16832 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDR2Q16832 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDR2Q16832 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDR2Q16832 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDR2Q16832 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDR2Q16832 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDR2Q16832 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DDR2Q16832 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDR2Q16832 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDR2Q16832 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDR2Q16832 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDR2Q16832 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDR2Q16832 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDR2Q16832 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDR2Q16832 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
DDR2Q16832 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDR2Q16832 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDR2Q16832 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDR2Q16832 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDR2Q16832 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDR2Q16832 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDR2Q16832 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDR2Q16832 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDR2Q16832 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDR2Q16832 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDR2Q16832 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDR2Q16832 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDR2Q16832 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDR2Q16832 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDR2Q16832 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDR2Q16832 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDR2Q16832 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDR2Q16832 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDR2Q16832 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDR2Q16832 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDR2Q16832 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDR2Q16832 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDR2Q16832 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDR2Q16832 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDR2Q16832 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDR2Q16832 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDR2Q16832 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDR2Q16832 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDR2Q16832 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDR2Q16832 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDR2Q16832 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDR2Q16832 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDR2Q16832 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDR2Q16832 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDR2Q16832 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDR2Q16832 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDR2Q16832 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDR2Q16832 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDR2Q16832 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDR2Q16832 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
DDR2Q16832 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDR2Q16832 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDR2Q16832 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDR2Q16832 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DDR2Q16832 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DDR2Q16832 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DDR2Q16832 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDR2Q16832 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
DDR2Q16832 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDR2Q16832 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDR2Q16832 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDR2Q16832 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDR2Q16832 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDR2Q16832 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDR2Q16832 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDR2Q16832 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDR2Q16832 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDR2Q16832 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDR2Q16832 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDR2Q16832 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms