Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
FOXD1Q16676 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
FOXD1Q16676 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
FOXD1Q16676 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
FOXD1Q16676 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
FOXD1Q16676 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
FOXD1Q16676 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
FOXD1Q16676 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
FOXD1Q16676 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
FOXD1Q16676 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
FOXD1Q16676 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
FOXD1Q16676 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
FOXD1Q16676 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
FOXD1Q16676 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
FOXD1Q16676 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
FOXD1Q16676 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
FOXD1Q16676 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
FOXD1Q16676 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
FOXD1Q16676 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
FOXD1Q16676 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
FOXD1Q16676 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
FOXD1Q16676 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
FOXD1Q16676 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
FOXD1Q16676 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
FOXD1Q16676 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
FOXD1Q16676 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
FOXD1Q16676 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
FOXD1Q16676 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
FOXD1Q16676 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
FOXD1Q16676 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
FOXD1Q16676 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
FOXD1Q16676 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
FOXD1Q16676 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
FOXD1Q16676 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
FOXD1Q16676 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
FOXD1Q16676 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
FOXD1Q16676 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
FOXD1Q16676 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
FOXD1Q16676 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
FOXD1Q16676 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
FOXD1Q16676 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
FOXD1Q16676 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
FOXD1Q16676 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
FOXD1Q16676 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.51
FOXD1Q16676 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
FOXD1Q16676 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
FOXD1Q16676 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
FOXD1Q16676 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
FOXD1Q16676 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
FOXD1Q16676 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
FOXD1Q16676 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
FOXD1Q16676 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
FOXD1Q16676 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
FOXD1Q16676 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
FOXD1Q16676 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
FOXD1Q16676 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
FOXD1Q16676 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
FOXD1Q16676 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
FOXD1Q16676 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
FOXD1Q16676 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
FOXD1Q16676 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
FOXD1Q16676 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
FOXD1Q16676 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
FOXD1Q16676 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
FOXD1Q16676 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
FOXD1Q16676 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
FOXD1Q16676 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
FOXD1Q16676 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
FOXD1Q16676 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
FOXD1Q16676 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
FOXD1Q16676 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
FOXD1Q16676 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
FOXD1Q16676 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
FOXD1Q16676 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
FOXD1Q16676 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
FOXD1Q16676 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
FOXD1Q16676 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
FOXD1Q16676 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
FOXD1Q16676 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
FOXD1Q16676 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
FOXD1Q16676 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
FOXD1Q16676 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
FOXD1Q16676 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
FOXD1Q16676 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
FOXD1Q16676 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
FOXD1Q16676 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
FOXD1Q16676 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
FOXD1Q16676 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
FOXD1Q16676 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
FOXD1Q16676 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
FOXD1Q16676 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
FOXD1Q16676 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
FOXD1Q16676 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
FOXD1Q16676 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
FOXD1Q16676 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
FOXD1Q16676 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
FOXD1Q16676 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
FOXD1Q16676 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
FOXD1Q16676 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
FOXD1Q16676 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
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