Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 CCDC14-202ENST00000409657 3815 ntTSL 25.46□□□□□ -1.548e-8■■■■■ 59.1
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SF3B4Q15427 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.288e-8■■■■■ 59.1
SF3B4Q15427 UNC13D-203ENST00000585574 658 ntTSL 315.73■□□□□ 0.115e-9■■■■■ 59
SF3B4Q15427 GAK-207ENST00000505819 1326 ntTSL 518.75■□□□□ 0.596e-7■■■■■ 58.9
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SF3B4Q15427 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.697e-8■■■■■ 58.9
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SF3B4Q15427 FNTA-205ENST00000526755 4676 ntTSL 1 (best)13.97□□□□□ -0.177e-8■■■■■ 58.9
SF3B4Q15427 FNTA-209ENST00000531266 590 ntTSL 510.57□□□□□ -0.727e-8■■■■■ 58.9
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SF3B4Q15427 FNTA-210ENST00000533336 874 ntTSL 36.36□□□□□ -1.397e-8■■■■■ 58.9
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SF3B4Q15427 SFSWAP-202ENST00000535202 567 ntTSL 27.77□□□□□ -1.173e-21■■■■■ 58.8
SF3B4Q15427 HGS-206ENST00000571647 2401 nt15.17■□□□□ 0.028e-9■■■■■ 58.8
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SF3B4Q15427 NPLOC4-210ENST00000572824 559 ntTSL 48.23□□□□□ -1.094e-10■■■■■ 58.7
SF3B4Q15427 NPLOC4-211ENST00000573212 564 ntTSL 47.4□□□□□ -1.224e-10■■■■■ 58.7
SF3B4Q15427 PEG3-207ENST00000599534 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)13.13□□□□□ -0.316e-22■■■■■ 58.7
SF3B4Q15427 PEG3-210ENST00000600833 1558 ntTSL 1 (best)8.38□□□□□ -1.076e-22■■■■■ 58.7
SF3B4Q15427 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.754e-8■■■■■ 58.6
SF3B4Q15427 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.754e-8■■■■■ 58.6
SF3B4Q15427 TMED4-204ENST00000477639 1950 ntTSL 219.06■□□□□ 0.644e-8■■■■■ 58.6
SF3B4Q15427 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.544e-8■■■■■ 58.6
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SF3B4Q15427 ZNF337-201ENST00000252979 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.284e-11■■■■■ 58.5
SF3B4Q15427 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.364e-11■■■■■ 58.5
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SF3B4Q15427 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 57.7
SF3B4Q15427 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 57.7
SF3B4Q15427 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 57.7
SF3B4Q15427 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 57.7
SF3B4Q15427 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 57.7
SF3B4Q15427 TXNDC5-205ENST00000475802 582 ntTSL 210.67□□□□□ -0.76e-14■■■■■ 57.7
SF3B4Q15427 TXNDC5-202ENST00000460138 2704 ntTSL 210.35□□□□□ -0.756e-14■■■■■ 57.7
SF3B4Q15427 HDAC3-214ENST00000495485 797 ntTSL 39.08□□□□□ -0.964e-12■■■■■ 57.7
SF3B4Q15427 HDAC3-206ENST00000471968 529 ntTSL 36.1□□□□□ -1.434e-12■■■■■ 57.7
SF3B4Q15427 SAT1-207ENST00000474223 1033 ntTSL 25.42□□□□□ -1.549e-9■■■■■ 57.6
SF3B4Q15427 SAT1-205ENST00000462639 826 ntTSL 23.78□□□□□ -1.89e-9■■■■■ 57.6
SF3B4Q15427 TM9SF3-202ENST00000443638 868 ntTSL 34.63□□□□□ -1.675e-13■■■■■ 57.6
SF3B4Q15427 TM9SF3-203ENST00000464654 658 ntTSL 53.63□□□□□ -1.835e-13■■■■■ 57.6
SF3B4Q15427 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.491e-8■■■■■ 57.5
SF3B4Q15427 RNF121-210ENST00000530058 571 ntTSL 417.9■□□□□ 0.461e-8■■■■■ 57.5
SF3B4Q15427 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.371e-8■■■■■ 57.5
SF3B4Q15427 RNF121-212ENST00000530655 786 ntTSL 316.03■□□□□ 0.161e-8■■■■■ 57.5
SF3B4Q15427 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.011e-8■■■■■ 57.5
SF3B4Q15427 RNF121-209ENST00000528683 721 ntTSL 214.78□□□□□ -0.041e-8■■■■■ 57.5
SF3B4Q15427 RNF121-204ENST00000490867 840 ntTSL 514.52□□□□□ -0.091e-8■■■■■ 57.5
SF3B4Q15427 RNF121-202ENST00000393711 608 ntTSL 513.38□□□□□ -0.271e-8■■■■■ 57.5
SF3B4Q15427 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.471e-8■■■■■ 57.5
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