Protein–RNA interactions for Protein: Q15404

RSU1, Ras suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSU1Q15404 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RSU1Q15404 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RSU1Q15404 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RSU1Q15404 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RSU1Q15404 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RSU1Q15404 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RSU1Q15404 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RSU1Q15404 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSU1Q15404 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSU1Q15404 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSU1Q15404 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSU1Q15404 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSU1Q15404 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSU1Q15404 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSU1Q15404 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSU1Q15404 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSU1Q15404 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSU1Q15404 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSU1Q15404 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSU1Q15404 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSU1Q15404 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RSU1Q15404 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RSU1Q15404 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RSU1Q15404 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RSU1Q15404 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RSU1Q15404 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RSU1Q15404 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RSU1Q15404 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RSU1Q15404 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RSU1Q15404 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RSU1Q15404 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RSU1Q15404 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RSU1Q15404 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RSU1Q15404 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RSU1Q15404 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RSU1Q15404 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RSU1Q15404 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms