Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

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Length 812 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC41Q15345 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC41Q15345 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC41Q15345 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC41Q15345 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LRRC41Q15345 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC41Q15345 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC41Q15345 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC41Q15345 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC41Q15345 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC41Q15345 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC41Q15345 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC41Q15345 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC41Q15345 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC41Q15345 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC41Q15345 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC41Q15345 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC41Q15345 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC41Q15345 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC41Q15345 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC41Q15345 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC41Q15345 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC41Q15345 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC41Q15345 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC41Q15345 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC41Q15345 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC41Q15345 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC41Q15345 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC41Q15345 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC41Q15345 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC41Q15345 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC41Q15345 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC41Q15345 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC41Q15345 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC41Q15345 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC41Q15345 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC41Q15345 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC41Q15345 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC41Q15345 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC41Q15345 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC41Q15345 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRC41Q15345 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC41Q15345 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRC41Q15345 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRC41Q15345 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC41Q15345 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC41Q15345 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC41Q15345 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
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