Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IRF4Q15306 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRF4Q15306 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRF4Q15306 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRF4Q15306 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
IRF4Q15306 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRF4Q15306 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRF4Q15306 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRF4Q15306 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRF4Q15306 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRF4Q15306 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRF4Q15306 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IRF4Q15306 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRF4Q15306 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRF4Q15306 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRF4Q15306 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRF4Q15306 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IRF4Q15306 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRF4Q15306 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRF4Q15306 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IRF4Q15306 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRF4Q15306 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF4Q15306 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152 ms