Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms