Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBFBQ13951 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CBFBQ13951 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBFBQ13951 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBFBQ13951 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBFBQ13951 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBFBQ13951 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBFBQ13951 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBFBQ13951 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBFBQ13951 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBFBQ13951 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBFBQ13951 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBFBQ13951 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBFBQ13951 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBFBQ13951 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBFBQ13951 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBFBQ13951 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBFBQ13951 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBFBQ13951 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBFBQ13951 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBFBQ13951 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CBFBQ13951 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBFBQ13951 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBFBQ13951 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
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