Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXE3Q13461 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXE3Q13461 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXE3Q13461 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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FOXE3Q13461 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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FOXE3Q13461 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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