Protein–RNA interactions for Protein: Q13454

TUSC3, Tumor suppressor candidate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3Q13454 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUSC3Q13454 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUSC3Q13454 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TUSC3Q13454 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUSC3Q13454 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUSC3Q13454 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUSC3Q13454 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUSC3Q13454 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUSC3Q13454 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
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