Protein–RNA interactions for Protein: Q13454

TUSC3, Tumor suppressor candidate 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3Q13454 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TUSC3Q13454 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUSC3Q13454 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TUSC3Q13454 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TUSC3Q13454 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUSC3Q13454 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUSC3Q13454 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TUSC3Q13454 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUSC3Q13454 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUSC3Q13454 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUSC3Q13454 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUSC3Q13454 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUSC3Q13454 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
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