Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3BQ13214 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3BQ13214 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3BQ13214 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3BQ13214 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3BQ13214 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3BQ13214 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3BQ13214 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA3BQ13214 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA3BQ13214 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3BQ13214 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3BQ13214 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3BQ13214 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3BQ13214 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3BQ13214 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3BQ13214 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3BQ13214 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3BQ13214 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3BQ13214 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3BQ13214 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA3BQ13214 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA3BQ13214 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3BQ13214 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3BQ13214 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3BQ13214 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3BQ13214 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3BQ13214 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3BQ13214 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3BQ13214 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3BQ13214 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3BQ13214 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3BQ13214 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3BQ13214 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3BQ13214 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3BQ13214 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3BQ13214 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3BQ13214 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA3BQ13214 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA3BQ13214 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA3BQ13214 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA3BQ13214 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA3BQ13214 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA3BQ13214 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA3BQ13214 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3BQ13214 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3BQ13214 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3BQ13214 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3BQ13214 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3BQ13214 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3BQ13214 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3BQ13214 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3BQ13214 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3BQ13214 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3BQ13214 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3BQ13214 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3BQ13214 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3BQ13214 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3BQ13214 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3BQ13214 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3BQ13214 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3BQ13214 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SEMA3BQ13214 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms