Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IFT88Q13099 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT88Q13099 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT88Q13099 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT88Q13099 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT88Q13099 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT88Q13099 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT88Q13099 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT88Q13099 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT88Q13099 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT88Q13099 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT88Q13099 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT88Q13099 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT88Q13099 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT88Q13099 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT88Q13099 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT88Q13099 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT88Q13099 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT88Q13099 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT88Q13099 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT88Q13099 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT88Q13099 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT88Q13099 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT88Q13099 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT88Q13099 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT88Q13099 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT88Q13099 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT88Q13099 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT88Q13099 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT88Q13099 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT88Q13099 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT88Q13099 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT88Q13099 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT88Q13099 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT88Q13099 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT88Q13099 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT88Q13099 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT88Q13099 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT88Q13099 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT88Q13099 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT88Q13099 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT88Q13099 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT88Q13099 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT88Q13099 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT88Q13099 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT88Q13099 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT88Q13099 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT88Q13099 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT88Q13099 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms