Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM32Q13049 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM32Q13049 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM32Q13049 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIM32Q13049 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIM32Q13049 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM32Q13049 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM32Q13049 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM32Q13049 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM32Q13049 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM32Q13049 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM32Q13049 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM32Q13049 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM32Q13049 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM32Q13049 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM32Q13049 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM32Q13049 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM32Q13049 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM32Q13049 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM32Q13049 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM32Q13049 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM32Q13049 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM32Q13049 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM32Q13049 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM32Q13049 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM32Q13049 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM32Q13049 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM32Q13049 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM32Q13049 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM32Q13049 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM32Q13049 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM32Q13049 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM32Q13049 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM32Q13049 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM32Q13049 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM32Q13049 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM32Q13049 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM32Q13049 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM32Q13049 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM32Q13049 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM32Q13049 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM32Q13049 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM32Q13049 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM32Q13049 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM32Q13049 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM32Q13049 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM32Q13049 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM32Q13049 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM32Q13049 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM32Q13049 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM32Q13049 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM32Q13049 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM32Q13049 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM32Q13049 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM32Q13049 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM32Q13049 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM32Q13049 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM32Q13049 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM32Q13049 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM32Q13049 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM32Q13049 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM32Q13049 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM32Q13049 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM32Q13049 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM32Q13049 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM32Q13049 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM32Q13049 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM32Q13049 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM32Q13049 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms