Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY3A-GQ12173 YIL177CYIL177C 5277 nt8.14□□□□□ -1.11
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TY3A-GQ12173 GET2YER083C 858 nt8.13□□□□□ -1.11
TY3A-GQ12173 SKP1YDR328C 585 nt8.12□□□□□ -1.11
TY3A-GQ12173 LIA1YJR070C 978 nt8.12□□□□□ -1.11
TY3A-GQ12173 HOC1YJR075W 1191 nt8.12□□□□□ -1.11
TY3A-GQ12173 PPZ2YDR436W 2133 nt8.12□□□□□ -1.11
TY3A-GQ12173 NAF1YNL124W 1479 nt8.12□□□□□ -1.11
TY3A-GQ12173 DCR2YLR361C 1737 nt8.12□□□□□ -1.11
TY3A-GQ12173 TUB1YML085C 1344 nt8.11□□□□□ -1.11
TY3A-GQ12173 ALG7YBR243C 1347 nt8.11□□□□□ -1.11
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TY3A-GQ12173 DUR3YHL016C 2208 nt8.07□□□□□ -1.12
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TY3A-GQ12173 MDH1YKL085W 1005 nt8.05□□□□□ -1.12
TY3A-GQ12173 YPR076WYPR076W 375 nt8.05□□□□□ -1.12
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TY3A-GQ12173 HXT11YOL156W 1704 nt8.04□□□□□ -1.12
TY3A-GQ12173 FYV1YDR024W 486 nt8.04□□□□□ -1.12
TY3A-GQ12173 THI6YPL214C 1623 nt8.03□□□□□ -1.12
TY3A-GQ12173 YJL163CYJL163C 1668 nt8.03□□□□□ -1.12
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TY3A-GQ12173 DRE2YKR071C 1047 nt7.91□□□□□ -1.14
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TY3A-GQ12173 MET13YGL125W 1803 nt7.87□□□□□ -1.15
TY3A-GQ12173 RBS1YDL189W 1374 nt7.87□□□□□ -1.15
TY3A-GQ12173 DIA4YHR011W 1341 nt7.87□□□□□ -1.15
TY3A-GQ12173 ELP6YMR312W 822 nt7.87□□□□□ -1.15
TY3A-GQ12173 MRPS18YNL306W 654 nt7.87□□□□□ -1.15
TY3A-GQ12173 PFS2YNL317W 1398 nt7.86□□□□□ -1.15
TY3A-GQ12173 PLB2YMR006C 2121 nt7.85□□□□□ -1.15
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TY3A-GQ12173 RPL2BYIL018W 765 nt7.85□□□□□ -1.15
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