Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGM3Q08188 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGM3Q08188 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGM3Q08188 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGM3Q08188 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGM3Q08188 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGM3Q08188 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TGM3Q08188 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TGM3Q08188 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TGM3Q08188 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TGM3Q08188 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TGM3Q08188 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TGM3Q08188 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGM3Q08188 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGM3Q08188 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGM3Q08188 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGM3Q08188 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TGM3Q08188 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TGM3Q08188 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TGM3Q08188 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TGM3Q08188 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TGM3Q08188 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGM3Q08188 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGM3Q08188 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGM3Q08188 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TGM3Q08188 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TGM3Q08188 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TGM3Q08188 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TGM3Q08188 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TGM3Q08188 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TGM3Q08188 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TGM3Q08188 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TGM3Q08188 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TGM3Q08188 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TGM3Q08188 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TGM3Q08188 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TGM3Q08188 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TGM3Q08188 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TGM3Q08188 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TGM3Q08188 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TGM3Q08188 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TGM3Q08188 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TGM3Q08188 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TGM3Q08188 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TGM3Q08188 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TGM3Q08188 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TGM3Q08188 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TGM3Q08188 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TGM3Q08188 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TGM3Q08188 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TGM3Q08188 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TGM3Q08188 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TGM3Q08188 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TGM3Q08188 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TGM3Q08188 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TGM3Q08188 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TGM3Q08188 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TGM3Q08188 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TGM3Q08188 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TGM3Q08188 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TGM3Q08188 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TGM3Q08188 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms