Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 GNA1YFL017C 480 nt6.28□□□□□ -1.4
HRD1Q08109 CPR2YHR057C 618 nt6.28□□□□□ -1.4
HRD1Q08109 SLG1YOR008C 1137 nt6.28□□□□□ -1.4
HRD1Q08109 PUP1YOR157C 786 nt6.28□□□□□ -1.4
HRD1Q08109 RTC2YBR147W 891 nt6.28□□□□□ -1.4
HRD1Q08109 YER152W-AYER152W-A 567 nt6.27□□□□□ -1.41
HRD1Q08109 MAL31YBR298C 1845 nt6.27□□□□□ -1.41
HRD1Q08109 CAR2YLR438W 1275 nt6.25□□□□□ -1.41
HRD1Q08109 YPC1YBR183W 951 nt6.25□□□□□ -1.41
HRD1Q08109 BNA3YJL060W 1335 nt6.25□□□□□ -1.41
HRD1Q08109 CIR2YOR356W 1896 nt6.24□□□□□ -1.41
HRD1Q08109 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.24□□□□□ -1.41
HRD1Q08109 YIL168WYIL168W 384 nt6.24□□□□□ -1.41
HRD1Q08109 DCR2YLR361C 1737 nt6.24□□□□□ -1.41
HRD1Q08109 YOR041CYOR041C 432 nt6.23□□□□□ -1.41
HRD1Q08109 YEN1YER041W 2280 nt6.22□□□□□ -1.41
HRD1Q08109 TPI1YDR050C 747 nt6.22□□□□□ -1.41
HRD1Q08109 YDR327WYDR327W 327 nt6.22□□□□□ -1.41
HRD1Q08109 YER137CYER137C 447 nt6.22□□□□□ -1.41
HRD1Q08109 GTS1YGL181W 1191 nt6.22□□□□□ -1.41
HRD1Q08109 TDH1YJL052W 999 nt6.22□□□□□ -1.41
HRD1Q08109 SNA3YJL151C 402 nt6.22□□□□□ -1.41
HRD1Q08109 ECM30YLR436C 3825 nt6.22□□□□□ -1.41
HRD1Q08109 YBL113CYBL113C 2379 nt6.21□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 YDR215CYDR215C 414 nt6.21□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 UTR5YEL035C 501 nt6.21□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 ERV25YML012W 636 nt6.21□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 YML034C-AYML034C-A 399 nt6.21□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 INP54YOL065C 1155 nt6.21□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 STE3YKL178C 1413 nt6.21□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 DAL80YKR034W 810 nt6.2□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 VPS65YLR322W 315 nt6.2□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 YAH1YPL252C 519 nt6.2□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 DAL4YIR028W 1908 nt6.2□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 YHR131CYHR131C 2553 nt6.19□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 GET2YER083C 858 nt6.19□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 CDC23YHR166C 1881 nt6.18□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 TPK1YJL164C 1194 nt6.18□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 VBA5YKR105C 1749 nt6.18□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 ERG24YNL280C 1317 nt6.18□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 YNL295WYNL295W 1575 nt6.18□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 TCB1YOR086C 3561 nt6.17□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 RRP43YCR035C 1185 nt6.17□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 QCR6YFR033C 444 nt6.17□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 YJL043WYJL043W 774 nt6.17□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 HNM1YGL077C 1692 nt6.17□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 CAN1YEL063C 1773 nt6.16□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 RPL12BYDR418W 498 nt6.16□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 OPI1YHL020C 1215 nt6.16□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 HMS2YJR147W 1077 nt6.16□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 PRY2YKR013W 990 nt6.16□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 MEU1YLR017W 1014 nt6.16□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 YPT10YBR264C 600 nt6.16□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 ADA2YDR448W 1305 nt6.16□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 SPR1YOR190W 1338 nt6.16□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 EMP65YER140W 1671 nt6.16□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 PSP2YML017W 1782 nt6.16□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 YLL058WYLL058W 1728 nt6.15□□□□□ -1.42
HRD1Q08109 YKR018CYKR018C 2178 nt6.14□□□□□ -1.43
HRD1Q08109 MSS51YLR203C 1311 nt6.14□□□□□ -1.43
HRD1Q08109 PNS1YOR161C 1620 nt6.14□□□□□ -1.43
HRD1Q08109 SKY1YMR216C 2229 nt6.13□□□□□ -1.43
HRD1Q08109 PSA1YDL055C 1086 nt6.13□□□□□ -1.43
HRD1Q08109 BIM1YER016W 1035 nt6.13□□□□□ -1.43
HRD1Q08109 YIA6YIL006W 1122 nt6.13□□□□□ -1.43
HRD1Q08109 HRA1HRA1 564 nt6.13□□□□□ -1.43
HRD1Q08109 TAD2YJL035C 753 nt6.13□□□□□ -1.43
HRD1Q08109 CPT1YNL130C 1182 nt6.13□□□□□ -1.43
HRD1Q08109 PPZ2YDR436W 2133 nt6.13□□□□□ -1.43
HRD1Q08109 PRB1YEL060C 1908 nt6.12□□□□□ -1.43
HRD1Q08109 STS1YIR011C 960 nt6.12□□□□□ -1.43
HRD1Q08109 GDH1YOR375C 1365 nt6.12□□□□□ -1.43
HRD1Q08109 ELP4YPL101W 1371 nt6.12□□□□□ -1.43
HRD1Q08109 DSC3YOR223W 879 nt6.11□□□□□ -1.43
HRD1Q08109 RMD8YFR048W 1989 nt6.09□□□□□ -1.43
HRD1Q08109 YKL147CYKL147C 618 nt6.09□□□□□ -1.43
HRD1Q08109 ERV2YPR037C 591 nt6.09□□□□□ -1.43
HRD1Q08109 RSP5YER125W 2430 nt6.09□□□□□ -1.43
HRD1Q08109 BDS1YOL164W 1941 nt6.09□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 AFG3YER017C 2286 nt6.09□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 SPS1YDR523C 1473 nt6.09□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 FLC2YAL053W 2352 nt6.08□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 MRP1YDR347W 966 nt6.08□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 HAC1YFL031W 717 nt6.08□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 YGL260WYGL260W 231 nt6.08□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 TOD6YBL054W 1578 nt6.08□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 OSM1YJR051W 1506 nt6.08□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 GPA1YHR005C 1419 nt6.08□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 NUP53YMR153W 1428 nt6.08□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 SEC24YIL109C 2781 nt6.06□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 YDR476CYDR476C 675 nt6.06□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 GRH1YDR517W 1119 nt6.06□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 LIP5YOR196C 1245 nt6.06□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 FRE5YOR384W 2085 nt6.05□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 SOD2YHR008C 702 nt6.05□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt6.05□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 UBP13YBL067C 2244 nt6.05□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 YBR284WYBR284W 2394 nt6.04□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 NOG2YNR053C 1461 nt6.04□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 CLN1YMR199W 1641 nt6.04□□□□□ -1.44
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