Protein–RNA interactions for Protein: Q07960

ARHGAP1, Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP1Q07960 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP1Q07960 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP1Q07960 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP1Q07960 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP1Q07960 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP1Q07960 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP1Q07960 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP1Q07960 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP1Q07960 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP1Q07960 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP1Q07960 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP1Q07960 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP1Q07960 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGAP1Q07960 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGAP1Q07960 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGAP1Q07960 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGAP1Q07960 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGAP1Q07960 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGAP1Q07960 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGAP1Q07960 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGAP1Q07960 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGAP1Q07960 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGAP1Q07960 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGAP1Q07960 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGAP1Q07960 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGAP1Q07960 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGAP1Q07960 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARHGAP1Q07960 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARHGAP1Q07960 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGAP1Q07960 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGAP1Q07960 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGAP1Q07960 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGAP1Q07960 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGAP1Q07960 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGAP1Q07960 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGAP1Q07960 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGAP1Q07960 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGAP1Q07960 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGAP1Q07960 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGAP1Q07960 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGAP1Q07960 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGAP1Q07960 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGAP1Q07960 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGAP1Q07960 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGAP1Q07960 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ARHGAP1Q07960 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ARHGAP1Q07960 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGAP1Q07960 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGAP1Q07960 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGAP1Q07960 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGAP1Q07960 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGAP1Q07960 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGAP1Q07960 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGAP1Q07960 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGAP1Q07960 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGAP1Q07960 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGAP1Q07960 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGAP1Q07960 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGAP1Q07960 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGAP1Q07960 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGAP1Q07960 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGAP1Q07960 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGAP1Q07960 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGAP1Q07960 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGAP1Q07960 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP1Q07960 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP1Q07960 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP1Q07960 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP1Q07960 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP1Q07960 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP1Q07960 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGAP1Q07960 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGAP1Q07960 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms