Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNK2Q07912 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TNK2Q07912 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNK2Q07912 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNK2Q07912 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNK2Q07912 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNK2Q07912 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TNK2Q07912 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNK2Q07912 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNK2Q07912 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNK2Q07912 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNK2Q07912 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TNK2Q07912 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNK2Q07912 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNK2Q07912 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNK2Q07912 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNK2Q07912 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNK2Q07912 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNK2Q07912 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNK2Q07912 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNK2Q07912 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNK2Q07912 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNK2Q07912 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNK2Q07912 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNK2Q07912 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNK2Q07912 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TNK2Q07912 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNK2Q07912 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNK2Q07912 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNK2Q07912 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNK2Q07912 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNK2Q07912 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNK2Q07912 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNK2Q07912 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNK2Q07912 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNK2Q07912 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNK2Q07912 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNK2Q07912 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNK2Q07912 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNK2Q07912 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNK2Q07912 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TNK2Q07912 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNK2Q07912 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TNK2Q07912 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNK2Q07912 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNK2Q07912 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNK2Q07912 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNK2Q07912 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNK2Q07912 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNK2Q07912 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNK2Q07912 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNK2Q07912 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNK2Q07912 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNK2Q07912 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNK2Q07912 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TNK2Q07912 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNK2Q07912 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNK2Q07912 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNK2Q07912 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNK2Q07912 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNK2Q07912 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNK2Q07912 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNK2Q07912 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNK2Q07912 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNK2Q07912 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNK2Q07912 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNK2Q07912 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNK2Q07912 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNK2Q07912 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms