Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDE4BQ07343 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDE4BQ07343 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDE4BQ07343 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDE4BQ07343 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PDE4BQ07343 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDE4BQ07343 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDE4BQ07343 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDE4BQ07343 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDE4BQ07343 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDE4BQ07343 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
PDE4BQ07343 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDE4BQ07343 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDE4BQ07343 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDE4BQ07343 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDE4BQ07343 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PDE4BQ07343 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDE4BQ07343 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDE4BQ07343 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDE4BQ07343 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDE4BQ07343 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE4BQ07343 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE4BQ07343 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE4BQ07343 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE4BQ07343 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE4BQ07343 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE4BQ07343 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE4BQ07343 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE4BQ07343 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE4BQ07343 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE4BQ07343 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE4BQ07343 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE4BQ07343 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE4BQ07343 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE4BQ07343 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE4BQ07343 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE4BQ07343 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE4BQ07343 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE4BQ07343 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE4BQ07343 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE4BQ07343 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE4BQ07343 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE4BQ07343 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE4BQ07343 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE4BQ07343 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE4BQ07343 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE4BQ07343 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE4BQ07343 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDE4BQ07343 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDE4BQ07343 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDE4BQ07343 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE4BQ07343 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PDE4BQ07343 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PDE4BQ07343 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PDE4BQ07343 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PDE4BQ07343 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDE4BQ07343 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDE4BQ07343 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDE4BQ07343 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDE4BQ07343 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDE4BQ07343 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDE4BQ07343 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDE4BQ07343 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDE4BQ07343 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDE4BQ07343 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDE4BQ07343 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDE4BQ07343 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDE4BQ07343 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDE4BQ07343 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PDE4BQ07343 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms