Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.35□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.35□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 OPI1YHL020C 1215 nt8.35□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 SLM4YBR077C 489 nt8.35□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 EAF5YEL018W 840 nt8.34□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 NIF3YGL221C 867 nt8.34□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 PPA2YMR267W 933 nt8.34□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 PUP1YOR157C 786 nt8.34□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 YDR161WYDR161W 1164 nt8.33□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 YGL235WYGL235W 537 nt8.33□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 SPO12YHR152W 522 nt8.33□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 APS2YJR058C 444 nt8.33□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 RNH1YMR234W 1047 nt8.33□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 ERG12YMR208W 1332 nt8.32□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 RFC1YOR217W 2586 nt8.32□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 SAN1YDR143C 1833 nt8.32□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 TCA17YEL048C 459 nt8.32□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 GPM1YKL152C 744 nt8.32□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 LEU2YCL018W 1095 nt8.32□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 YPL245WYPL245W 1365 nt8.32□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 KAR1YNL188W 1302 nt8.31□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 SAW1YAL027W 786 nt8.31□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 HEM14YER014W 1620 nt8.31□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 NAM8YHR086W 1572 nt8.31□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 TUB4YLR212C 1422 nt8.3□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 NBA1YOL070C 1506 nt8.3□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 GCV1YDR019C 1203 nt8.3□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 CDA2YLR308W 939 nt8.3□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 OAZ1YPL052W 879 nt8.3□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 HXK1YFR053C 1458 nt8.3□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 CLD1YGR110W 1338 nt8.29□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 THI3YDL080C 1830 nt8.29□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 CTF18YMR078C 2226 nt8.29□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 PET18YCR020C 648 nt8.29□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 YGR291CYGR291C 222 nt8.29□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 SBP1YHL034C 885 nt8.29□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt8.29□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 GSF2YML048W 1212 nt8.29□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 SPE2YOL052C 1191 nt8.29□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt8.29□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 TOK1YJL093C 2076 nt8.28□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 CLB4YLR210W 1383 nt8.28□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 MPC54YOR177C 1395 nt8.28□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 MCM21YDR318W 1107 nt8.28□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 YJL064WYJL064W 396 nt8.28□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 SPG5YMR191W 1122 nt8.28□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 YNL194CYNL194C 906 nt8.28□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 MSO1YNR049C 633 nt8.28□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 RRS1YOR294W 612 nt8.28□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 SRP54YPR088C 1626 nt8.28□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 PAF1YBR279W 1338 nt8.28□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 PRP40YKL012W 1752 nt8.27□□□□□ -1.08
HDA3Q06623 YBL095WYBL095W 813 nt8.27□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 RAD17YOR368W 1206 nt8.27□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 GGA2YHR108W 1758 nt8.27□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 PAR32YDL173W 888 nt8.26□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 INM1YHR046C 888 nt8.26□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 NAS2YIL007C 663 nt8.26□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 SEC28YIL076W 891 nt8.26□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 YIP3YNL044W 531 nt8.26□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 KRE1YNL322C 942 nt8.26□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 FET5YFL041W 1869 nt8.26□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 APM4YOL062C 1476 nt8.26□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.25□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 PAU19YMR325W 375 nt8.25□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 ALD5YER073W 1563 nt8.24□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 DIN7YDR263C 1293 nt8.24□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 MSP1YGR028W 1089 nt8.24□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 GTR1YML121W 933 nt8.24□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 MTG1YMR097C 1104 nt8.24□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 PFA4YOL003C 1137 nt8.24□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 YMC2YBR104W 990 nt8.24□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 REX2YLR059C 810 nt8.23□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 YBR089WYBR089W 600 nt8.23□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 MTO1YGL236C 2010 nt8.23□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 AAT1YKL106W 1356 nt8.22□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 NUF2YOL069W 1356 nt8.22□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 RPN5YDL147W 1338 nt8.22□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 SMF3YLR034C 1422 nt8.21□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 GAS1YMR307W 1680 nt8.21□□□□□ -1.09
HDA3Q06623 TRP2YER090W 1524 nt8.21□□□□□ -1.1
HDA3Q06623 LSM6YDR378C 261 nt8.21□□□□□ -1.1
HDA3Q06623 YEA4YEL004W 1029 nt8.21□□□□□ -1.1
HDA3Q06623 ADH4YGL256W 1149 nt8.21□□□□□ -1.1
HDA3Q06623 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt8.21□□□□□ -1.1
HDA3Q06623 ATG19YOL082W 1248 nt8.21□□□□□ -1.1
HDA3Q06623 MCT1YOR221C 1083 nt8.21□□□□□ -1.1
HDA3Q06623 PTC6YCR079W 1329 nt8.21□□□□□ -1.1
HDA3Q06623 CMK1YFR014C 1341 nt8.21□□□□□ -1.1
HDA3Q06623 YGR168CYGR168C 1131 nt8.2□□□□□ -1.1
HDA3Q06623 XPT1YJR133W 630 nt8.2□□□□□ -1.1
HDA3Q06623 CDD1YLR245C 429 nt8.2□□□□□ -1.1
HDA3Q06623 YNL226WYNL226W 411 nt8.2□□□□□ -1.1
HDA3Q06623 PTC4YBR125C 1182 nt8.2□□□□□ -1.1
HDA3Q06623 YIR043CYIR043C 693 nt8.19□□□□□ -1.1
HDA3Q06623 YKR012CYKR012C 378 nt8.19□□□□□ -1.1
HDA3Q06623 IDI1YPL117C 867 nt8.19□□□□□ -1.1
HDA3Q06623 YBR292CYBR292C 372 nt8.19□□□□□ -1.1
HDA3Q06623 GLE1YDL207W 1617 nt8.18□□□□□ -1.1
HDA3Q06623 THI6YPL214C 1623 nt8.18□□□□□ -1.1
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