Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABPB1Q06547 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GABPB1Q06547 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABPB1Q06547 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABPB1Q06547 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GABPB1Q06547 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABPB1Q06547 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABPB1Q06547 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABPB1Q06547 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABPB1Q06547 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABPB1Q06547 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABPB1Q06547 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABPB1Q06547 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABPB1Q06547 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GABPB1Q06547 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GABPB1Q06547 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GABPB1Q06547 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GABPB1Q06547 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABPB1Q06547 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABPB1Q06547 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABPB1Q06547 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABPB1Q06547 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABPB1Q06547 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GABPB1Q06547 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GABPB1Q06547 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GABPB1Q06547 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GABPB1Q06547 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GABPB1Q06547 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GABPB1Q06547 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABPB1Q06547 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABPB1Q06547 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABPB1Q06547 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABPB1Q06547 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABPB1Q06547 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABPB1Q06547 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABPB1Q06547 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABPB1Q06547 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABPB1Q06547 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABPB1Q06547 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABPB1Q06547 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABPB1Q06547 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABPB1Q06547 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABPB1Q06547 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABPB1Q06547 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GABPB1Q06547 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GABPB1Q06547 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GABPB1Q06547 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GABPB1Q06547 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GABPB1Q06547 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GABPB1Q06547 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABPB1Q06547 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABPB1Q06547 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABPB1Q06547 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABPB1Q06547 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABPB1Q06547 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABPB1Q06547 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABPB1Q06547 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABPB1Q06547 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABPB1Q06547 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABPB1Q06547 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABPB1Q06547 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABPB1Q06547 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABPB1Q06547 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABPB1Q06547 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABPB1Q06547 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABPB1Q06547 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABPB1Q06547 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABPB1Q06547 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABPB1Q06547 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABPB1Q06547 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms