Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCDQ05655 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCDQ05655 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCDQ05655 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCDQ05655 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCDQ05655 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCDQ05655 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCDQ05655 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCDQ05655 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCDQ05655 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCDQ05655 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCDQ05655 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCDQ05655 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCDQ05655 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCDQ05655 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCDQ05655 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCDQ05655 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCDQ05655 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCDQ05655 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCDQ05655 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCDQ05655 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCDQ05655 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCDQ05655 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCDQ05655 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKCDQ05655 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKCDQ05655 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCDQ05655 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms