Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SP4Q02446 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SP4Q02446 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SP4Q02446 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SP4Q02446 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SP4Q02446 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SP4Q02446 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SP4Q02446 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SP4Q02446 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SP4Q02446 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SP4Q02446 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SP4Q02446 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SP4Q02446 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SP4Q02446 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SP4Q02446 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SP4Q02446 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SP4Q02446 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SP4Q02446 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SP4Q02446 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SP4Q02446 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SP4Q02446 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SP4Q02446 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SP4Q02446 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SP4Q02446 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SP4Q02446 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SP4Q02446 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SP4Q02446 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SP4Q02446 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SP4Q02446 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SP4Q02446 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SP4Q02446 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SP4Q02446 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SP4Q02446 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SP4Q02446 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SP4Q02446 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SP4Q02446 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SP4Q02446 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SP4Q02446 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SP4Q02446 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SP4Q02446 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SP4Q02446 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SP4Q02446 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SP4Q02446 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SP4Q02446 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SP4Q02446 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SP4Q02446 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SP4Q02446 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SP4Q02446 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SP4Q02446 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SP4Q02446 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SP4Q02446 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SP4Q02446 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SP4Q02446 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SP4Q02446 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SP4Q02446 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SP4Q02446 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SP4Q02446 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SP4Q02446 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SP4Q02446 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SP4Q02446 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SP4Q02446 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SP4Q02446 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SP4Q02446 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SP4Q02446 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SP4Q02446 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SP4Q02446 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SP4Q02446 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SP4Q02446 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SP4Q02446 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SP4Q02446 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SP4Q02446 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SP4Q02446 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SP4Q02446 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SP4Q02446 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SP4Q02446 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SP4Q02446 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SP4Q02446 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SP4Q02446 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SP4Q02446 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SP4Q02446 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SP4Q02446 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SP4Q02446 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SP4Q02446 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SP4Q02446 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SP4Q02446 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SP4Q02446 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SP4Q02446 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SP4Q02446 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SP4Q02446 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SP4Q02446 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SP4Q02446 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SP4Q02446 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SP4Q02446 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SP4Q02446 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SP4Q02446 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SP4Q02446 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SP4Q02446 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SP4Q02446 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SP4Q02446 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SP4Q02446 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms