Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HDLBPQ00341 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HDLBPQ00341 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HDLBPQ00341 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HDLBPQ00341 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HDLBPQ00341 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HDLBPQ00341 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HDLBPQ00341 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HDLBPQ00341 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HDLBPQ00341 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HDLBPQ00341 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
HDLBPQ00341 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HDLBPQ00341 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HDLBPQ00341 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HDLBPQ00341 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HDLBPQ00341 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HDLBPQ00341 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HDLBPQ00341 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HDLBPQ00341 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HDLBPQ00341 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
HDLBPQ00341 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HDLBPQ00341 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HDLBPQ00341 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HDLBPQ00341 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HDLBPQ00341 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HDLBPQ00341 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HDLBPQ00341 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HDLBPQ00341 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
HDLBPQ00341 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HDLBPQ00341 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HDLBPQ00341 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HDLBPQ00341 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HDLBPQ00341 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HDLBPQ00341 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HDLBPQ00341 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HDLBPQ00341 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HDLBPQ00341 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HDLBPQ00341 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HDLBPQ00341 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HDLBPQ00341 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HDLBPQ00341 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HDLBPQ00341 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HDLBPQ00341 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HDLBPQ00341 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HDLBPQ00341 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HDLBPQ00341 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HDLBPQ00341 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HDLBPQ00341 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HDLBPQ00341 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HDLBPQ00341 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HDLBPQ00341 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
HDLBPQ00341 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
HDLBPQ00341 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HDLBPQ00341 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HDLBPQ00341 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HDLBPQ00341 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HDLBPQ00341 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
HDLBPQ00341 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
HDLBPQ00341 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HDLBPQ00341 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HDLBPQ00341 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HDLBPQ00341 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
HDLBPQ00341 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HDLBPQ00341 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HDLBPQ00341 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HDLBPQ00341 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HDLBPQ00341 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HDLBPQ00341 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HDLBPQ00341 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HDLBPQ00341 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HDLBPQ00341 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HDLBPQ00341 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HDLBPQ00341 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HDLBPQ00341 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
HDLBPQ00341 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
HDLBPQ00341 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
HDLBPQ00341 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HDLBPQ00341 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HDLBPQ00341 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HDLBPQ00341 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HDLBPQ00341 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HDLBPQ00341 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HDLBPQ00341 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
HDLBPQ00341 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HDLBPQ00341 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HDLBPQ00341 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HDLBPQ00341 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HDLBPQ00341 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HDLBPQ00341 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HDLBPQ00341 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HDLBPQ00341 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms