Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP2R2BQ00005 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPP2R2BQ00005 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP2R2BQ00005 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP2R2BQ00005 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP2R2BQ00005 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP2R2BQ00005 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP2R2BQ00005 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP2R2BQ00005 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP2R2BQ00005 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP2R2BQ00005 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP2R2BQ00005 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP2R2BQ00005 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP2R2BQ00005 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP2R2BQ00005 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP2R2BQ00005 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP2R2BQ00005 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP2R2BQ00005 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP2R2BQ00005 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP2R2BQ00005 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP2R2BQ00005 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP2R2BQ00005 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms