Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FGD1P98174 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FGD1P98174 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FGD1P98174 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
FGD1P98174 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FGD1P98174 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FGD1P98174 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FGD1P98174 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FGD1P98174 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FGD1P98174 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FGD1P98174 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FGD1P98174 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FGD1P98174 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
FGD1P98174 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FGD1P98174 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FGD1P98174 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FGD1P98174 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FGD1P98174 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FGD1P98174 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FGD1P98174 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FGD1P98174 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
FGD1P98174 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FGD1P98174 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FGD1P98174 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FGD1P98174 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FGD1P98174 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FGD1P98174 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FGD1P98174 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FGD1P98174 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FGD1P98174 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
FGD1P98174 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FGD1P98174 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FGD1P98174 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FGD1P98174 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FGD1P98174 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FGD1P98174 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FGD1P98174 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FGD1P98174 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FGD1P98174 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
FGD1P98174 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
FGD1P98174 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
FGD1P98174 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FGD1P98174 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FGD1P98174 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FGD1P98174 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FGD1P98174 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FGD1P98174 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FGD1P98174 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FGD1P98174 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FGD1P98174 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FGD1P98174 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FGD1P98174 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FGD1P98174 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FGD1P98174 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FGD1P98174 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FGD1P98174 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FGD1P98174 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FGD1P98174 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FGD1P98174 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FGD1P98174 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FGD1P98174 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FGD1P98174 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FGD1P98174 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FGD1P98174 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FGD1P98174 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FGD1P98174 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FGD1P98174 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FGD1P98174 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FGD1P98174 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FGD1P98174 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FGD1P98174 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FGD1P98174 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FGD1P98174 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FGD1P98174 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FGD1P98174 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FGD1P98174 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FGD1P98174 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FGD1P98174 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FGD1P98174 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FGD1P98174 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FGD1P98174 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
FGD1P98174 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FGD1P98174 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FGD1P98174 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FGD1P98174 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FGD1P98174 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FGD1P98174 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FGD1P98174 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FGD1P98174 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FGD1P98174 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FGD1P98174 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FGD1P98174 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FGD1P98174 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FGD1P98174 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FGD1P98174 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FGD1P98174 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FGD1P98174 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FGD1P98174 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FGD1P98174 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FGD1P98174 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms