Protein–RNA interactions for Protein: P78382

SLC35A1, CMP-sialic acid transporter, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A1P78382 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC35A1P78382 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC35A1P78382 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC35A1P78382 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC35A1P78382 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC35A1P78382 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC35A1P78382 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC35A1P78382 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC35A1P78382 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC35A1P78382 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC35A1P78382 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC35A1P78382 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC35A1P78382 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC35A1P78382 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC35A1P78382 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC35A1P78382 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC35A1P78382 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC35A1P78382 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC35A1P78382 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC35A1P78382 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC35A1P78382 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35A1P78382 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35A1P78382 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35A1P78382 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35A1P78382 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35A1P78382 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35A1P78382 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35A1P78382 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35A1P78382 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35A1P78382 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35A1P78382 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC35A1P78382 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35A1P78382 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35A1P78382 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35A1P78382 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35A1P78382 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35A1P78382 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35A1P78382 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35A1P78382 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35A1P78382 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35A1P78382 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35A1P78382 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35A1P78382 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35A1P78382 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35A1P78382 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35A1P78382 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35A1P78382 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35A1P78382 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35A1P78382 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35A1P78382 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35A1P78382 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35A1P78382 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35A1P78382 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35A1P78382 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35A1P78382 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35A1P78382 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC35A1P78382 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC35A1P78382 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC35A1P78382 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC35A1P78382 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC35A1P78382 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC35A1P78382 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC35A1P78382 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC35A1P78382 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC35A1P78382 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC35A1P78382 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC35A1P78382 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC35A1P78382 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC35A1P78382 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC35A1P78382 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC35A1P78382 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC35A1P78382 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC35A1P78382 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC35A1P78382 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms