Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP46P62068 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP46P62068 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP46P62068 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP46P62068 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP46P62068 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
USP46P62068 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP46P62068 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP46P62068 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP46P62068 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP46P62068 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP46P62068 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP46P62068 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP46P62068 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP46P62068 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP46P62068 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP46P62068 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP46P62068 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP46P62068 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP46P62068 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP46P62068 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP46P62068 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP46P62068 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP46P62068 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP46P62068 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
USP46P62068 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP46P62068 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP46P62068 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP46P62068 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP46P62068 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP46P62068 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP46P62068 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP46P62068 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP46P62068 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP46P62068 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP46P62068 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP46P62068 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP46P62068 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP46P62068 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP46P62068 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP46P62068 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP46P62068 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP46P62068 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP46P62068 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
USP46P62068 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP46P62068 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
USP46P62068 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP46P62068 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP46P62068 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP46P62068 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP46P62068 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP46P62068 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP46P62068 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
USP46P62068 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP46P62068 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP46P62068 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
USP46P62068 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP46P62068 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP46P62068 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP46P62068 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP46P62068 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP46P62068 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP46P62068 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP46P62068 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP46P62068 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP46P62068 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP46P62068 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP46P62068 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP46P62068 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP46P62068 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP46P62068 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP46P62068 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP46P62068 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP46P62068 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP46P62068 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP46P62068 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP46P62068 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP46P62068 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP46P62068 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP46P62068 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP46P62068 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP46P62068 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP46P62068 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP46P62068 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP46P62068 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP46P62068 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP46P62068 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP46P62068 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP46P62068 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP46P62068 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP46P62068 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP46P62068 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP46P62068 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP46P62068 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP46P62068 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP46P62068 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP46P62068 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP46P62068 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP46P62068 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP46P62068 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms