Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVFC1-1P60608 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVFC1-1P60608 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVFC1-1P60608 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVFC1-1P60608 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVFC1-1P60608 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVFC1-1P60608 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVFC1-1P60608 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVFC1-1P60608 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVFC1-1P60608 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVFC1-1P60608 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVFC1-1P60608 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms