Protein–RNA interactions for Protein: P57727

TMPRSS3, Transmembrane protease serine 3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS3P57727 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS3P57727 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS3P57727 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS3P57727 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS3P57727 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS3P57727 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS3P57727 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS3P57727 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS3P57727 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS3P57727 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPRSS3P57727 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPRSS3P57727 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPRSS3P57727 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms