Protein–RNA interactions for Protein: P55316

FOXG1, Forkhead box protein G1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXG1P55316 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXG1P55316 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXG1P55316 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXG1P55316 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXG1P55316 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXG1P55316 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXG1P55316 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXG1P55316 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXG1P55316 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXG1P55316 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXG1P55316 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXG1P55316 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FOXG1P55316 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXG1P55316 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXG1P55316 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms